MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 137095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002944	CCGG	2	8	201835	201842	0 %	0 %	50 %	50 %	41406294
5502	NC_002944	CCG	2	6	201851	201856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406294
5503	NC_002944	CAG	2	6	201886	201891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406294
5504	NC_002944	GCC	2	6	201892	201897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406294
5505	NC_002944	CAG	3	9	201907	201915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406294
5506	NC_002944	CG	3	6	201916	201921	0 %	0 %	50 %	50 %	41406294
5507	NC_002944	CG	3	6	201928	201933	0 %	0 %	50 %	50 %	41406294
5508	NC_002944	GGC	2	6	201967	201972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406294
5509	NC_002944	GTC	2	6	201974	201979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406294
5510	NC_002944	CAG	2	6	202050	202055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_002944	CGC	2	6	202056	202061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_002944	G	6	6	202104	202109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_002944	TGC	2	6	202110	202115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_002944	GGCCG	2	10	202123	202132	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5515	NC_002944	GCT	2	6	202168	202173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5516	NC_002944	CAA	2	6	202205	202210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406295
5517	NC_002944	TGG	2	6	202233	202238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406295
5518	NC_002944	GCT	2	6	202243	202248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5519	NC_002944	GCC	2	6	202250	202255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406295
5520	NC_002944	CGC	2	6	202258	202263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406295
5521	NC_002944	CCG	2	6	202264	202269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406295
5522	NC_002944	GCC	2	6	202271	202276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406295
5523	NC_002944	CCG	2	6	202284	202289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406295
5524	NC_002944	GC	3	6	202297	202302	0 %	0 %	50 %	50 %	41406295
5525	NC_002944	GCC	2	6	202334	202339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406295
5526	NC_002944	AGC	2	6	202347	202352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5527	NC_002944	CTG	2	6	202361	202366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5528	NC_002944	GCC	2	6	202400	202405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406295
5529	NC_002944	AGGCCG	2	12	202416	202427	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	41406295
5530	NC_002944	GGC	2	6	202429	202434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406295
5531	NC_002944	CCG	2	6	202440	202445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406295
5532	NC_002944	CGT	2	6	202465	202470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5533	NC_002944	CGG	2	6	202489	202494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406295
5534	NC_002944	GAC	2	6	202499	202504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5535	NC_002944	CGT	2	6	202519	202524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5536	NC_002944	ACC	2	6	202557	202562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406295
5537	NC_002944	GC	3	6	202650	202655	0 %	0 %	50 %	50 %	41406295
5538	NC_002944	TGC	2	6	202656	202661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5539	NC_002944	CTG	2	6	202670	202675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5540	NC_002944	GAT	2	6	202717	202722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406295
5541	NC_002944	CCG	2	6	202724	202729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406295
5542	NC_002944	GGCA	2	8	202753	202760	25 %	0 %	50 %	25 %	41406295
5543	NC_002944	GC	3	6	202773	202778	0 %	0 %	50 %	50 %	41406295
5544	NC_002944	GAG	2	6	202784	202789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406295
5545	NC_002944	CGA	2	6	202807	202812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5546	NC_002944	TGG	2	6	202821	202826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406295
5547	NC_002944	CGA	2	6	202861	202866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5548	NC_002944	CCG	2	6	202881	202886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406295
5549	NC_002944	GTC	2	6	202909	202914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5550	NC_002944	CGC	2	6	202922	202927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406295
5551	NC_002944	CGCC	2	8	203010	203017	0 %	0 %	25 %	75 %	41406295
5552	NC_002944	GCT	2	6	203041	203046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5553	NC_002944	TCG	2	6	203123	203128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5554	NC_002944	GCG	2	6	203129	203134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406295
5555	NC_002944	CCCA	2	8	203162	203169	25 %	0 %	0 %	75 %	41406295
5556	NC_002944	GACGTC	2	12	203188	203199	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5557	NC_002944	CAC	2	6	203206	203211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406295
5558	NC_002944	GC	3	6	203219	203224	0 %	0 %	50 %	50 %	41406295
5559	NC_002944	CGG	2	6	203248	203253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406295
5560	NC_002944	CAC	2	6	203305	203310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406295
5561	NC_002944	GCTG	2	8	203313	203320	0 %	25 %	50 %	25 %	41406295
5562	NC_002944	ACC	2	6	203337	203342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406295
5563	NC_002944	TCG	2	6	203388	203393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5564	NC_002944	GCT	2	6	203401	203406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5565	NC_002944	CG	3	6	203421	203426	0 %	0 %	50 %	50 %	41406295
5566	NC_002944	CGGG	2	8	203434	203441	0 %	0 %	75 %	25 %	41406296
5567	NC_002944	G	6	6	203439	203444	0 %	0 %	100 %	0 %	41406296
5568	NC_002944	CG	3	6	203470	203475	0 %	0 %	50 %	50 %	41406296
5569	NC_002944	GCC	2	6	203522	203527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406296
5570	NC_002944	CGC	2	6	203543	203548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406296
5571	NC_002944	CAG	2	6	203554	203559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406296
5572	NC_002944	TCG	2	6	203618	203623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406296
5573	NC_002944	GGC	2	6	203722	203727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406296
5574	NC_002944	GC	3	6	203726	203731	0 %	0 %	50 %	50 %	41406296
5575	NC_002944	GCCG	2	8	203733	203740	0 %	0 %	50 %	50 %	41406296
5576	NC_002944	CGG	2	6	203745	203750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406296
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5579	NC_002944	GC	3	6	203823	203828	0 %	0 %	50 %	50 %	41406296
5580	NC_002944	CCCGCG	2	12	203841	203852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406296
5581	NC_002944	GAT	2	6	203860	203865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406296
5582	NC_002944	GGCCG	2	10	203908	203917	0 %	0 %	60 %	40 %	41406296
5583	NC_002944	CGG	2	6	203918	203923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406296
5584	NC_002944	GCGG	2	8	203926	203933	0 %	0 %	75 %	25 %	41406296
5585	NC_002944	CAG	2	6	203987	203992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406296
5586	NC_002944	CCG	2	6	203994	203999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406296
5587	NC_002944	CCG	2	6	204039	204044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406296
5588	NC_002944	CGG	2	6	204124	204129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406296
5589	NC_002944	GCA	2	6	204202	204207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_002944	CGAC	2	8	204231	204238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5591	NC_002944	GCACCG	2	12	204273	204284	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	41406297
5592	NC_002944	CGGC	2	8	204293	204300	0 %	0 %	50 %	50 %	41406297
5593	NC_002944	AGG	2	6	204308	204313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406297
5594	NC_002944	CGA	2	6	204318	204323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406297
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5596	NC_002944	GTG	2	6	204553	204558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406297
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5599	NC_002944	CGT	2	6	204671	204676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406297
5600	NC_002944	CTG	2	6	204688	204693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406297
5601	NC_002944	GCCGG	2	10	204735	204744	0 %	0 %	60 %	40 %	41406297
5602	NC_002944	GGC	2	6	204747	204752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406297
5603	NC_002944	CGGC	2	8	204789	204796	0 %	0 %	50 %	50 %	41406297
5604	NC_002944	TCG	2	6	204875	204880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406298
5605	NC_002944	GCGAAC	2	12	204892	204903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406298
5606	NC_002944	CGG	2	6	204958	204963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406298
5607	NC_002944	GCA	3	9	204989	204997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406298
5608	NC_002944	CTGG	2	8	205020	205027	0 %	25 %	50 %	25 %	41406298
5609	NC_002944	GGC	2	6	205035	205040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406298
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5613	NC_002944	CCG	2	6	205216	205221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406298
5614	NC_002944	GCGGG	2	10	205222	205231	0 %	0 %	80 %	20 %	41406298
5615	NC_002944	CGA	2	6	205253	205258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406298
5616	NC_002944	GC	3	6	205311	205316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5617	NC_002944	GC	3	6	205401	205406	0 %	0 %	50 %	50 %	41406299
5618	NC_002944	AGCG	2	8	205407	205414	25 %	0 %	50 %	25 %	41406299
5619	NC_002944	GGA	2	6	205469	205474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406299
5620	NC_002944	CGC	2	6	205493	205498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406299
5621	NC_002944	CTG	2	6	205554	205559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406299
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5623	NC_002944	CGA	2	6	205616	205621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406299
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5840	NC_002944	GAG	3	9	212976	212984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5991	NC_002944	TGC	2	6	218338	218343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406310
5992	NC_002944	GTG	2	6	218372	218377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406310
5993	NC_002944	GAG	2	6	218406	218411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406310
5994	NC_002944	GCCGCT	2	12	218420	218431	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	41406310
5995	NC_002944	GAC	2	6	218445	218450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406310
5996	NC_002944	GC	3	6	218465	218470	0 %	0 %	50 %	50 %	41406310
5997	NC_002944	GAC	2	6	218541	218546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406310
5998	NC_002944	TGG	2	6	218587	218592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406310
5999	NC_002944	CGC	2	6	218594	218599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406310
6000	NC_002944	TGCC	2	8	218666	218673	0 %	25 %	25 %	50 %	41406310

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